引起肛门湿疹的病因很多，病因是复杂多变的，由多种因素相互影响而发病，难以确认某一单纯因素引发肛门湿疹，肛门湿疹的病因可以分原发性和继发性两种。常见的引起肛门湿疹的原因有：
(一)变态反应
这是发病的主要原因有内在和外在方面如病灶感染致敏的食物药物或接触某些致敏物品
(二)疾病因素
在某些疾病如内分泌失调营养不良消化功能紊乱肠道寄生虫病等的患病过程中病人对某些过敏性物质感受性增强容易诱发
(三)局部病变
如痔肛瘘肛裂肛门失禁等疾病的慢性炎症刺激也可诱发
(四)刺激性因素
肛门直接受到碘酒酒精强酸强碱等刺激而诱发湿疹
(五)神经功能障碍及内分泌失调
肛门湿疹的引发原因跟过度疲劳以及精神紧张、忧郁失眠有很大的关系。
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